Angiografię rezonansu magnetycznego wykonuje się do uwidocznienia zmian miażdżycowych w tętnicach szyjnych. Badanie to wykonuje się jako uzupełnienie lub rozszerzenie diagnostyki w USG Doppler w szczególnie trudnych przypadkach np. przy bardzo krętych naczyniach. Jakość uzyskanych obrazów jest porównywalna z angio - tomografii komputerowej.

Angiografia rezonansu magnetycznego głowy służy nieinwazyjnej ocenie naczyń mózgowych. Badanie to może stanowić element standardowego badania głowy lub oddzielne, dodatkowo zlecone badanie rezonansu magnetycznego.

Wskazaniami do wykonania angiografii rezonansu magnetycznego głowy jest podejrzenie tętniaków naczyń wewnątrzczaszkowych lub innych malformacji naczyniowych. Uzyskane obrazy cechują się nieco mniejszą rozdzielczością w stosunku do angio - CT, ale badanie to nie naraża pacjenta na promieniowanie rentgenowskie.