Zabieg polega na chirurgicznym nacięciu oraz oczyszczeniu torbieli gruczołu Bartholina. Następnie brzegi ścian torbieli są przecinane i wszywane w błonę śluzową, aby nie dopuścić do ponownego zamknięcia torbieli i wypełnienia płynem. Wycinek pobranego materiału wysyłana jest do badania histopatologicznego i bakteriologicznego.
Zabieg wykonywany jest w trybie chirurgii jednego dnia.
Procedura wykonywana jest w krótkim znieczuleniu dożylnym (ogólnym).
Oczyszczenie torbieli gruczołu Bartholina refundowane jest przez Narodowy Fundusz Zdrowia (NFZ).